Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RFKQ969G6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RFKQ969G6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RFKQ969G6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms