Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEAL3Q969E4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms