Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRF1Q92994 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRF1Q92994 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms