Protein–RNA interactions for Protein: Q92615

LARP4B, La-related protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4BQ92615 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LARP4BQ92615 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LARP4BQ92615 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms