Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG4AQ8WYN0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4AQ8WYN0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms