Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS9Q8WXC6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COPS9Q8WXC6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms