Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOMQ8WWX9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SELENOMQ8WWX9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366.5 ms