Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VN1R17PQ8TDU5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VN1R17PQ8TDU5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms