Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP1Q8TDR0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAF3IP1Q8TDR0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms