Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BEST2Q8NFU1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEST2Q8NFU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BEST2Q8NFU1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms