Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID1BQ8NFD5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARID1BQ8NFD5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms