Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBBP8NLQ8NC74 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8NLQ8NC74 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms