Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP38Q8NB14 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP38Q8NB14 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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