Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TTC29Q8NA56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTC29Q8NA56 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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