Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCNYL1Q8N7R7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNYL1Q8N7R7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNYL1Q8N7R7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNYL1Q8N7R7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNYL1Q8N7R7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNYL1Q8N7R7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms