Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSGALNACT2Q8N6G5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CSGALNACT2Q8N6G5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CSGALNACT2Q8N6G5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms