Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IFT20Q8IY31 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFT20Q8IY31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT20Q8IY31 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT20Q8IY31 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT20Q8IY31 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT20Q8IY31 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFT20Q8IY31 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms