Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPAP2Q8IXW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAP2Q8IXW5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAP2Q8IXW5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms