Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYT12Q8IV01 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT12Q8IV01 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT12Q8IV01 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms