Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCA5Q86VQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms