Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SYT9Q86SS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT9Q86SS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT9Q86SS6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms