Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NPM2Q86SE8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPM2Q86SE8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPM2Q86SE8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms