Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMC4Q7Z404 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TMC4Q7Z404 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMC4Q7Z404 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms