Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRP9Q7RTR0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NLRP9Q7RTR0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms