Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
HECW1Q76N89 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
HECW1Q76N89 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms