Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDZD4Q76G19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDZD4Q76G19 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PDZD4Q76G19 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms