Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SMIM5Q71RC9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SMIM5Q71RC9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SMIM5Q71RC9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms