Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00173Q6ZV60 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00173Q6ZV60 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms