Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RUFY4Q6ZNE9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms