Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GDPD4Q6W3E5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GDPD4Q6W3E5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD4Q6W3E5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD4Q6W3E5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD4Q6W3E5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDPD4Q6W3E5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms