Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO3Q6UWJ1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO3Q6UWJ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms