Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRSAM1Q6UWE0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRSAM1Q6UWE0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRSAM1Q6UWE0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms