Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNT2Q6UVM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNT2Q6UVM3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNT2Q6UVM3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms