Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTC3Q6UUV7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRTC3Q6UUV7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRTC3Q6UUV7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRTC3Q6UUV7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms