Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMARCD3Q6STE5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMARCD3Q6STE5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms