Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APOA5Q6Q788 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
APOA5Q6Q788 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms