Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC25A47Q6Q0C1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC25A47Q6Q0C1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC25A47Q6Q0C1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms