Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC137Q6PK04 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC137Q6PK04 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC137Q6PK04 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms