Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X5

C22orf39, UPF0545 protein C22orf39, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C22orf39Q6P5X5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C22orf39Q6P5X5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C22orf39Q6P5X5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms