Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLC3Q6P597 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLC3Q6P597 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLC3Q6P597 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms