Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6P435 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6P435 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6P435 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6P435 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6P435 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6P435 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6P435 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6P435 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P435 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P435 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P435 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q6P435 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q6P435 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P435 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P435 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms