Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTC41PQ6P2S7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TTC41PQ6P2S7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TTC41PQ6P2S7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms