Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
EDC4Q6P2E9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
EDC4Q6P2E9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
EDC4Q6P2E9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms