Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSANTD2Q6P1R3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSANTD2Q6P1R3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSANTD2Q6P1R3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms