Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEPROQ6NW34 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEPROQ6NW34 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEPROQ6NW34 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms