Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC144NLQ6NUI1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC144NLQ6NUI1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms