Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCAPH2Q6IBW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCAPH2Q6IBW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCAPH2Q6IBW4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms