Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT39Q6A163 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT39Q6A163 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms