Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
C9orf84Q5VXU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
C9orf84Q5VXU9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
C9orf84Q5VXU9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms