Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF20Q5VTR2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF20Q5VTR2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF20Q5VTR2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms